Ethics code: IR.UMSHA.REC.1400.875
Taheri M, Khavari F, Molaei P, Habibi P, Nouri F. Bioinformatic Evaluation of miR-222-3p Specificity in Binding to Genes Involved in Acute Lymphoblastic Leukemia in Children. Pajouhan Sci J 2022; 20 (3) :188-193
URL:
http://psj.umsha.ac.ir/article-1-885-fa.html
طاهری محمد، خاوری فاطمه، مولائی پژمان، حبیبی پریسا، نوری فاطمه. بررسی بیوانفورماتیک اختصاصیت miR-222-3p در اتصال به ژن های درگیر در لوسمی لنفوبلاستیک حاد در کودکان. مجله علمی پژوهان 1401; 20 (3) :193-188
URL: http://psj.umsha.ac.ir/article-1-885-fa.html
1- گروه میکروبیولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان،، همدان، ایران
2- کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران
3- مرکز تحقیقات نوروفیزیولوژی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران
4- گروه بیوتکنولوژی دارویی، دانشکده داروسازی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران ، fatemenouri1@gmail.com
چکیده: (350 مشاهده)
سابقه و هدف: لوسمی لنفوسیتی حاد (Acute lymphocytic leukemia) ALL، نوعی سرطان است که بر روی سلولهای سفید خون تأثیر میگذارد. این بیماری به سرعت پیشرفت میکند و نیاز به درمان فوری دارد. لوسمی لنفوبلاستیک حاد، شایعترین نوع لوسمی است که کودکان را تحت تأثیر قرار میدهد. در خلال این بیماری افزایش مولکول miR-222-3p مشاهده شده است. از روش ریزآرایه میتوان برای بررسی اتصالات این miRNA و ژنهای هدف استفاده کرد، که این مورد با محدودیتهایی روبهرو است. بر همین اساس، در این مطالعه، از روشهای کامپیوتری و بیوانفورماتیکی توسط نرمافزارهای مختلف و اختصاصی استفاده شد.
مواد و روشها: ژنهای هدف با استفاده از الگوریتمهای مختلف موجود در پایگاههای Mirbase، TargetScan، NCBI و RNAhybrid مشخص شدند و بر اساس امتیازات به دست آمده، اهداف دارای بالاترین تمایل شناسایی شدند.
یافتهها: یافتههای این مطالعه نشان داد که ژنهای CDH4، AJAP1، HNRNPA0، UBN1 و ZNF618 به عنوان اهداف بالقوه با اختصاصیت بالاتری برای miR-222-3p میباشند.
نتیجهگیری: دو عامل میزان انرژی آزاد منفی و تعداد جفت بازهای تشکیل شده بین miRNA و UTR-3’ ژنهای مختلف در انتخاب اهداف با اختصاصیت و تمایل بالاتر نقش دارند.
نوع مطالعه:
مقاله پژوهشي |
موضوع مقاله:
علوم پایه دریافت: 1400/11/12 | پذیرش: 1401/2/20 | انتشار: 1401/6/19